べつになんでもないこと

「エディタ」で編集保存する毎にHTMLソースの改行が増えていきます

1回目の編集
2回目の編集
3回目の編集

HTMLカスタマイズの内容が編集エリアに食い込んでます

エディタで編集中は「HTMLカスタマイズ」や「メッセージツール編集」に記述された内容を無効にした方が良いように思えます。